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Text File  |  1991-05-08  |  29KB  |  482 lines
  1. MacawDataFile ::= {
  2.  
  3. version { major 1, minor 1 },
  4.  
  5. sequences {
  6. { id 2, name "Human",
  7.   title "3' untranslated sequences from human c-myc gene\n",
  8.   seq-type nucleic,
  9.   seq-len 347, seq-efflen 347,
  10.   seq-data {
  11.     storage internal,
  12.     seq-text ".............TAAGGAAAAGTAAGGAAAACGATTCCTTCTAACAGAAATGTCCTGAG\n
  13.     CAATCACCTATGAACTTGTTTCAAATGCATGATCAAATGCAACCTCACAACCTTGGCTGA\n
  14.     GTCTTGAGACTGAAAGATTTAGCCATAATGTAAACTGCCTCAAATTGGACTTTGGGCATA\n
  15.     AAAGAACTTTTTTATGCTTACCATCTTTTTTTTTTCTTTAACAGATTTGTATTTAAGAAT\n
  16.     TGTTTTTAAAAAATTTTAAGATTTACACAATGTTTCTCTGTAAATATTGCCATTAAATGT\n
  17.     AAATAACTTTAATAAAACGTTTATAGCAGTTACACAGAATTTCAATCCTAGTATATAGTA\n
  18.     \n" } },
  19. { id 4, name "Cat",
  20.   title "3' untranslated sequence of feline c-myc gene\n",
  21.   seq-type nucleic,
  22.   seq-len 378, seq-efflen 378,
  23.   seq-data {
  24.     storage internal,
  25.     seq-text "..........................................TAAGTCCACCTATTAGAG\n
  26.     GGAGGAACTGGAGTTGCTCGTGAATTCTCACTTGTTACTAAGGGAAAGTAAGGAAAAAGC\n
  27.     TTCCTTCTCACAGAACTGTAGCAACTCCTCATATCTGAACTTGTTTCAAATGCATGGTCA\n
  28.     AGTGCAACCTCACAACCTTGGCTGGGTCTTAGGATTGAAAGGTTTAGCCATAATGTAAAC\n
  29.     TGCCTCAAATGGAATTTTGGGCATAAAAGAACATTTTTTTATGCTTGCCATCTTTTTGTT\n
  30.     TGTTTGTTTTCCTTTAACAGATTTGTATTTAAGAATTGTTTTTAAAAAATGTGTCAAGTT\n
  31.     TACCCCGTTTTCCTGTGTAAATATGGCCATTAAATGTAAATAACTTTAATAAAACGTTTA\n
  32.     \n" } },
  33. { id 6, name "Mouse",
  34.   title "c-myc 3'UT \n",
  35.   seq-type nucleic,
  36.   seq-len 375, seq-efflen 375,
  37.   seq-data {
  38.     storage internal,
  39.     seq-text "....................................TAAACTGACCTAACTCGAGGAGGA\n
  40.     GCTGGAATCTCTCGTGAGAGCTAAGGAGAACGGTTCCTTCTGACAGAACTGATGCGCTGG\n
  41.     AATTAAAATGCATGCCAAAGCCTAACCTCACAACCTTGGCTGGGGCTTTGGGACTGTAAG\n
  42.     CTTCAGCCATAATTTTAACTGCTCAACTAAATAGTATAAAAGAACTTTTTTTTATGCTTC\n
  43.     CCACTCTTTTTTCTTTTTCCTTTTAACAGATTTGTATTTAATTGTTTTTTTAAAAAATCG\n
  44.     TTAAAATCTATCCAATTTTCCATGTAAATAGGGCCTTGAAATGTAAACAACTTTAATAAA\n
  45.     ACGTTTATAACAGTTACAAAAGATTTTAAGACATGTACCATAATTTTTTTT\n
  46.     \n" } },
  47. { id 8, name "Chicken",
  48.   title "c-myc 3'UT\n",
  49.   seq-type nucleic,
  50.   seq-len 434, seq-efflen 434,
  51.   seq-data {
  52.     storage internal,
  53.     seq-text "..............................................TAGGAACTCTTGGA\n
  54.     CATCACTTAGAATACCCCAAACTAGACTGAAACTATGATAAAATATTAGTGTTTCTAATA\n
  55.     TCACTCATGAACTACATCAGTCCATTGAGTATGGAACTATTGCAACTGCATGCTGTGCGA\n
  56.     CTTAACTTGAGACTACACAACCTTGGCCGAATCTCCGAACGGTTTGGCCAGAACCTCAAA\n
  57.     ACTGCCTCATAATTGATACTTTGGGCATAAGGGATGATGGGACATTCTTCATGCTTGGGG\n
  58.     ATGAACTCTTCAACTTTTTTTCTTTTAAAATTTTGTATTTAAGGCATTTTTTCTTAGCGA\n
  59.     GAATTCCAAATAGAGTTGTCCCCAGATTGCTGTATATATTTACACATCTTCTTGCCATGT\n
  60.     AAATACCTTTAATAAAGTCTTTATAGAAAAATGTGCAACATTAATACACAGCAGTTGTGG\n
  61.     \n" } },
  62. { id 10, name "Xenopus",
  63.   title "c-myc 3'UT\n",
  64.   seq-type nucleic,
  65.   seq-len 402, seq-efflen 402,
  66.   seq-data {
  67.     storage internal,
  68.     seq-text "..................TAATTCACAAACTCTTATTTAACACTTTATATAAACTGTGAC\n
  69.     CGTCTATATCAAGGTTGTCTCTTCCTCGAGACCGACTACAAAACTGAATTTGTAGAACAT\n
  70.     GGACAACTGCATGCAGATGATTTCACAACTACACAACCTTGGCATGGTCTCAAACAGATT\n
  71.     CTGCCAGCACCTTAAAACTGCCTCAATACTGGGATTTGGGTATTATGGGACTTTGTTTTT\n
  72.     TTTTTTTTCTTGCTTGAGGGGGTATATTTGCCAACTTTTTGTTTGTTTGTTATTGTTTTT\n
  73.     ACAACCTTTTGTATTTAAAACATTTAATCTTTCAAGTTTCATTTGAATAATTCTGTATTG\n
  74.     GAGCTAGTTGTACCAGTTTCTGAAGAACTGATGAAGAAGGCACTGACCAACATGTAATTT\n" }
  75.      }
  76. },
  77.  
  78. blocks {
  79. { id 12,
  80.   time-link 673732272,
  81.   num-seqs 5,
  82.   block-seqs {
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  154. { id 649,
  155.   time-link 673732700,
  156.   num-seqs 5,
  157.   block-seqs {
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  164.   curr-pos 194, curr-len 7,
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  166.   srch-N 1.20393000e+009,
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  169. },
  170.  
  171. worksheet {
  172.   id 1, title "c-myc 3' untranslated sequences ", seq-type amino,
  173.   num-slots 16, num-cols 466, slot-list {
  174.     { seq-id 2, slot-num 0, row-num 1,
  175.     gap-seq "TAAGGAAAAGTAAGGAAAACGATTCCTTCTAACAGAAATGTCCTGAGCAATCACCTATGAACT
  176.     TGTTTC--------------------------------------------------------AAATGCATGA
  177.     TCAAATGCAACCT---------CACAACCTTGGCTGAGTCTTGAGACTGAAAGATTTAGCCATAATGT-AAA
  178.     CTGCCTCAAATTGGACTTTGGGCATAAAAGAAC-------------TTTTTTATGCTTACCATCTTTTTTTT
  179.     TTCTTTAACAGA--------------------------TTTGTATTTAAGAATTGTTTTTAAAAAATTTTAA
  180.     GATTTACACAATGTTTCTCTGTAAATATTGCCATTAAATGTAAATAACTTTAATAAAACGTTTATAGCAGTT
  181.     ACACAGAATTTCAATCCTAGTATATAGTA--------------",
  182.     link-map {
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